Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms