Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms