Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRNL1Q5VV63 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms