Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms