Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAT1Q5SQI0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAT1Q5SQI0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAT1Q5SQI0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAT1Q5SQI0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms