Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNT1Q5JUK3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms