Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms