Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms