Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms