Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms