Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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KRTAP21-3Q3LHN1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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KRTAP21-3Q3LHN1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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KRTAP21-3Q3LHN1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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KRTAP21-3Q3LHN1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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KRTAP21-3Q3LHN1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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KRTAP21-3Q3LHN1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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KRTAP21-3Q3LHN1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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KRTAP21-3Q3LHN1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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KRTAP21-3Q3LHN1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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KRTAP21-3Q3LHN1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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