Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP41Q3LFD5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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