Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms