Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX7Q2KHR2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms