Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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