Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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