Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
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FOXD1Q16676 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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