Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF2Q15853 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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