Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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