Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms