Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms