Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms