Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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