Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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GBX1Q14549 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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