Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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