Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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