Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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