Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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