Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTCH1Q13635 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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