Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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PKD2Q13563 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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