Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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