Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms