Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms