Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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