Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM32Q13049 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM32Q13049 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms