Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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