Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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