Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFCP2Q12800 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFCP2Q12800 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms