Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXO1Q12778 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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