Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPSF1Q10570 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
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