Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms