Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC1Q08554 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC1Q08554 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC1Q08554 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC1Q08554 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
DSC1Q08554 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC1Q08554 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms