Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms