Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms