Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms