Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms