Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPCAP84074 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPCAP84074 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPCAP84074 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPCAP84074 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPCAP84074 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPCAP84074 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPCAP84074 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HPCAP84074 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPCAP84074 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPCAP84074 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPCAP84074 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPCAP84074 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPCAP84074 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPCAP84074 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPCAP84074 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPCAP84074 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms