Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG7P83436 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG7P83436 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COG7P83436 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG7P83436 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
COG7P83436 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG7P83436 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG7P83436 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG7P83436 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG7P83436 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG7P83436 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG7P83436 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms