Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX3P78415 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX3P78415 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRX3P78415 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms