Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKP1P63208 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP1P63208 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP1P63208 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP1P63208 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP1P63208 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP1P63208 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP1P63208 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP1P63208 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP1P63208 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms